Музей истории, археологии и этнографии Сибири им. В. М. Флоринского Томского государственного университета основан в 1882 году.

Фонды музея формировались за счет частных пожертвований и дарений. В дальнейшем комплектование осуществлялось учеными университета из экспедиционных материалов. В настоящее время фонды насчитывают около 300 тысяч единиц хранения.

Археологические коллекции освещают древнюю историю, духовную и бытовую культуру народов Западной и Восточной Сибири, Приуралья, Дальнего Востока, Казахстана, Монголии, Причерноморья, Скандинавии.

Этнографические материалы собраны у народов Сибири, Монголии, Китая, Японии, Кореи, Северной Америки, европейской части России и русского старожильческого населения Сибири.

Нумизматическая коллекция музея включает монеты и боны стран Европы, Азии, Африки и Америки, в том числе древних периодов истории.

В историческом фонде представлено оружие и средства защиты эпохи Средневековья и Нового времени, в частности образцы мастерства испанских, немецких, русских и азиатских оружейников, а также предметы религиозного культа.

Музей располагает библиотекой, имеет собрание фотографий и коллекцию изобразительного искусства конца XIX–XX века. В нем хранятся рисунки В. И. Сурикова, Г. И. Гуркина, томских художников начала XX века: А. А. Ворониной-Уткиной и П. М. Кошарова.

Музейное собрание используется в исследовательской, образовательной и культурно-просветительской деятельности университета. Часть коллекций экспонируется и открыта для посетителей.